A program indulása nem volt teljesen problémamentes, az uniós csatlakozás azt igényelte a politikai döntéshozóktól, hogy a pályázati programokat minél előbb megjelentessék, hiszen erre a csatlakozásról szóló népszavazáson ígéretet is tettek. A pályázati felhívások gyors megjelentetése viszont kapkodáshoz vezetett, korrekt társadalmi vita nélkül jelent meg az összes intézkedés leírása 2004. március 31-én, melynek eredménye az lett, hogy a későbbiekben többször kellett módosítani a pályázati felhívásokat és a csomagokat.

Az AVOP végrehajtása során a Mezőgazdasági és Vidékfejlesztési Hivatal munkatársai 2006. december 1-ig, összesen 10 289 db pályázatot regisztráltak, amelyeket a pályázók 8+1 pályázati felhívás keretében nyújtottak be. A plusz egy felhívást a LEADER+ program jelentette, melynek keretében 3 384 pályázat érkezett be.

Pénzügyi teljesítési adatok (LEADER nélkül):
AVOP 3 éves (2004-2006) keret:	106 milliárd Ft
Beérkezett pályázatok támogatásigénye	183 milliárd Ft
Megítélt támogatás	113 milliárd Ft
Hatályos szerződések támogatástartalma:	105 milliárd Ft
Kifizetett támogatás:	66 milliárd Ft

forrás: MVH, decemberi támogatási adatok

A korábban említett adminisztrációs terhek ellenére megállapítható, hogy a hivatal sikerrel vette az akadályokat a pályázatok bírálata során. A hiánypótlások és az információkérések révén el lehetett érni, hogy a pályázatok ne elutasításra, hanem támogatásra kerüljenek, ami jelentősen javította a pályázók hivatalba vetett bizalmát.

A pályázati felhívások és csomagok többszöri javítása és megjelenése révén a programidőszak közepére olyan pályázatok kerültek kidolgozásra, melyek más hazai illetve nemzetközi programokkal összevetve is megállták a helyüket. A pályázati adatlapok többszöri módosítása azt is elősegítette, hogy a pályázók minél jobban átgondolják a fejlesztéseik hatását és jövedelmezőségét, még akkor is, ha a pályázatokat nem maguk, hanem tanácsadó cégek készítették el.

Mindez hozzájárult ahhoz is, hogy a pályázók megtanultak tervezni, azaz a fejlesztéseik megfontoltabbá váltak. Ez az átgondoltság a következő programozási időszak során fog előtérbe kerülni és hasznot hozni, arra lehet számítani, hogy az Európai Mezőgazdasági és Vidékfejlesztési Alapból (EMVA) finanszírozott Új Magyarország Vidékfejlesztési Program hasonlóan az AVOP-hoz intenzív pályázati kedvvel fog elindulni, de a fejlesztési elképzelések még kidolgozottabbak lesznek, ami csak annyiban nehezíti meg a hivatal munkáját, hogy a jó pályázatok közül kell majd kiválasztani a legjobbakat.

Forrás: Tanulmány az AVOP program működéséről